A gazdagréti vezető református lelkipásztor, Thoma László egy februári igehirdetése során arról beszélt, hogy Balog Zoltánnak a kegyelmi botrány kapcsán le kellett volna mondania püspöki pozíciójáról is. Július elején arról értesítette az egyházkerülete, hogy szeptembertől nem folytathatja a munkát a Károli Gáspár Református Egyetemen, ahol az elmúlt tanévben félállásban volt adjunktus, mivel az egyházkerület nem támogatja - számolt be az RTL.
A lelkész ennek kapcsán levelet írt a híveinek, amelyben azt állítja, személyesen is beszélt Baloggal, aki megerősítette, hogy azért nem dolgozhat tovább, mert korábban lemondásra szólította fel. Balog állítólag úgy fogalmazott, hogy „a döntés februári igehirdetésének következménye, de ne vegye azt büntetésnek”. Thoma László azt is írta levelében: fájt neki és igazságtalanságként élte meg a döntést, de elfogadta.
Balog Zoltán saját bevallása szerint személyesen lobbizott Novák Katalinnál K. Endre elnöki kegyelméért. A kegyelmi botrány kirobbanása után lemondott a református egyház zsinati elnöki tisztségéről, de a püspökségről nem.